真菌学(Mycology,源自希腊文μύκης)是研究真菌的学门,探讨真菌的遗传学、生物化学或是分类学,以及真菌对人类的用途等,包括火种,医药(例如:青霉素),食物(例如:啤酒,葡萄酒,奶酪,可食用菌等),和宗教致幻剂,以及它们的危险,如中毒或感染。专门从事真菌学研究的生物学家被称为真菌学家。研究植物病害的学门植物病理学是真菌学的分支领域之一,绝大多数的植物病原体皆是真菌。在历史上,真菌学是植物学的一个分支,这是因为真菌曾经被归类为植物。现在已知真菌演化上的亲缘关系较接近的是动物而不是植物,直到几十年前这是未被识别的。先驱真菌学家包括伊利阿斯·马格努斯·弗里斯,克里斯蒂安·亨德里克·珀森等。

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